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Accueil > La Recherche > Axes & Equipes > Nanostructures & Spectroscopies > Equipe : Nanomatériaux > Thème : Nanomatériaux supramoléculaires
Relation structure-réactivité des foldamères
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Présentation
Les oligomères non naturels appelés "foldamères" sont capables d’adopter des structures repliées bien définies imitant les structures secondaires des protéines, telles que les alpha-hélices, les beta-brins ou les rubans. Leur structure secondaire, leur résistance à la dégradation enzymatique et leur capacité à traverser les membranes cellulaires les rendent particulièrement appropriés pour le développement d’inhibiteurs d’interaction protéine-protéine, de vecteurs pour l’administration de médicaments, d’antimicrobiens ou de catalyseurs bio-inspirés.
L’étude des interactions liées à l’hydrogène stabilisant la structure secondaire de notre système de foldamères de type peptidique en milieu biologique est donc cruciale.
Deux questions cruciales ont été étudiées : i) l’effet de la liaison H sur les vibrations en fonction du type d’hélicité, ii) la relation entre la structure et l’activité biologique de tels outils thérapeutiques.
Des expériences de spectroscopie infrarouge et de RMN, couplées à des calculs ab initio, effectués dans le système de foldamères à base d’alpha-amino-gamma-lactame ont montré la capacité de ces oligomères à se replier sous la forme d’une structure secondaire hélicoïdale, contrôlée par un réseau de liaisons hydrogène interne [1].
Nous avons également développé une méthode pour la détermination des structures des oligo-gamma-peptides basée sur le couplage des spectroscopies RMN et IRTF, révélant ainsi des marqueurs structurels utiles pour suivre le degré d’organisation des peptides basés sur l’ATC. [2]. Nos investigations vibratoires ont conduit à une compréhension plus détaillée des interactions de liaison H dans les séquences d’acides aminés courtes que celle rapportée précédemment [3]. Nos résultats indiquent que les foldamers de poly-alpha-amino-gamma-lactame (Agl-AA) qui ont adopté une structure en forme de ruban contribuent à l’efficacité de l’absorption cellulaire [4].
Ce travail a été réalisé en collaboration avec l’IBMM (Montpellier) et l’Université Nationale de Chunghuk (Corée).
Bibliographie
[1] Angewandte Chemie International Edition (2015) 54(47), 13966-13970
[2] Org. and Biomolecular Chemistry (2016) 14(37), 8664
[3] Chemistry - A Eur. J.l (2016) 22, 11986-11990
[4] Chembiochem (2017) 18(21), 2110-2114
